Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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