Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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