Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EEA1Q15075 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EEA1Q15075 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
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