Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
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COL19A1Q14993 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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COL19A1Q14993 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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COL19A1Q14993 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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COL19A1Q14993 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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COL19A1Q14993 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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COL19A1Q14993 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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COL19A1Q14993 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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COL19A1Q14993 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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COL19A1Q14993 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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COL19A1Q14993 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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