Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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