Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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