Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LAMC2Q13753 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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