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| FHL3 | Q13643 | ATG2A-203 | ENST00000421419 | 1481 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AP000777.2-201 | ENST00000539897 | 501 nt | TSL 4 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| FHL3 | Q13643 | BRF1-219 | ENST00000551787 | 824 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
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| FHL3 | Q13643 | LINC00668-203 | ENST00000579012 | 605 nt | TSL 3 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| FHL3 | Q13643 | TBX18-206 | ENST00000606784 | 1230 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| FHL3 | Q13643 | NMRK2-205 | ENST00000616156 | 1139 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| FHL3 | Q13643 | SRGAP2B-207 | ENST00000641863 | 2367 nt | APPRIS P5 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| FHL3 | Q13643 | USP25-204 | ENST00000400183 | 5341 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.34 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZNF416-201 | ENST00000196489 | 2561 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.34 | | |
| FHL3 | Q13643 | JAK2-201 | ENST00000381652 | 5285 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.34 | | |
| FHL3 | Q13643 | INPP4A-205 | ENST00000409851 | 3365 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.34 | | |
| FHL3 | Q13643 | FOS-208 | ENST00000555686 | 1496 nt | TSL 2 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.34 | | |
| FHL3 | Q13643 | HCG11-201 | ENST00000411553 | 5696 nt | BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.34 | | |
| FHL3 | Q13643 | BMP2K-201 | ENST00000335016 | 3804 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.34 | | |
| FHL3 | Q13643 | ELF2-207 | ENST00000510408 | 1965 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.34 | | |
| FHL3 | Q13643 | FTCDNL1-204 | ENST00000622774 | 1997 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.34 | | |
| FHL3 | Q13643 | HFE2-201 | ENST00000336751 | 2234 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.34 | | |
| FHL3 | Q13643 | DTX2-202 | ENST00000413936 | 2472 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.34 | | |
| FHL3 | Q13643 | MAPK7-201 | ENST00000299612 | 2715 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.34 | | |
| FHL3 | Q13643 | NKAIN4-202 | ENST00000370313 | 1421 nt | TSL 3 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.34 | | |
| FHL3 | Q13643 | MFGE8-201 | ENST00000268150 | 1937 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.34 | | |
| FHL3 | Q13643 | PRPF19-201 | ENST00000227524 | 2157 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.34 | | |