Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms