Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PWP1Q13610 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms