Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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