Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACACAQ13085 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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