Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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