Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6Q03468 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms