Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFITM3Q01628 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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