Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms