Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPCAP84074 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPCAP84074 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPCAP84074 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPCAP84074 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms