Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFM1P61960 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFM1P61960 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFM1P61960 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFM1P61960 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFM1P61960 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UFM1P61960 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFM1P61960 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFM1P61960 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFM1P61960 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UFM1P61960 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFM1P61960 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFM1P61960 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFM1P61960 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms