Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VBP1P61758 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VBP1P61758 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VBP1P61758 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VBP1P61758 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VBP1P61758 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms