Protein–RNA interactions for Protein: P58546

MTPN, Myotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTPNP58546 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTPNP58546 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTPNP58546 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MTPNP58546 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MTPNP58546 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MTPNP58546 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTPNP58546 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms