Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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FAM3BP58499 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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FAM3BP58499 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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FAM3BP58499 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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FAM3BP58499 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FAM3BP58499 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FAM3BP58499 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FAM3BP58499 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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