Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF1P55201 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms