Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms