Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLK1P49759 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLK1P49759 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLK1P49759 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLK1P49759 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLK1P49759 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLK1P49759 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLK1P49759 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLK1P49759 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLK1P49759 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLK1P49759 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLK1P49759 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLK1P49759 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLK1P49759 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms