Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms