Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC1P35052 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPC1P35052 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms