Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALB2P22676 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CALB2P22676 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALB2P22676 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALB2P22676 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALB2P22676 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALB2P22676 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALB2P22676 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALB2P22676 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALB2P22676 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALB2P22676 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALB2P22676 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALB2P22676 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALB2P22676 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALB2P22676 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALB2P22676 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALB2P22676 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms