Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK11BP21127 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms