Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB1P18505 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms