Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSPP15924 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSPP15924 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSPP15924 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSPP15924 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSPP15924 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSPP15924 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DSPP15924 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DSPP15924 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms