Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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