Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOC1P02654 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOC1P02654 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOC1P02654 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOC1P02654 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOC1P02654 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOC1P02654 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOC1P02654 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOC1P02654 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC1P02654 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC1P02654 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms