Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBDO15205 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBDO15205 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBDO15205 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms