Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
APAF1O14727 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APAF1O14727 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APAF1O14727 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APAF1O14727 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APAF1O14727 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APAF1O14727 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APAF1O14727 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APAF1O14727 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APAF1O14727 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms