Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms