Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCC3Q9ULS5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms