Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms