Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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VAX2Q9UIW0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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VAX2Q9UIW0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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VAX2Q9UIW0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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VAX2Q9UIW0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAX2Q9UIW0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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