Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms