Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC17A6Q9P2U8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms