Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms