Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMTM6Q9NX76 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms