Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOMER3Q9NSC5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms