Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms