Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSPNQ9HAW4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms