Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms