Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LNPKQ9C0E8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LNPKQ9C0E8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LNPKQ9C0E8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms