Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms