Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms