Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF354BQ96LW1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms