Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms